Bioinformatiker (w/m/d) für die Neuropathologie

What to expect

Wir sind das Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE). Die pulsierende Gesundheitsstadt inmitten von Hamburg. Rund 14.400 Mitarbeiter:innen mit sehr unterschiedlichen Aufgaben eint hier das gleiche Ziel: das Wohl unserer Patient:innen.

Im Institut für Neuropathologie beschäftigen wir uns mit der Erforschung neurodegenerativer Erkrankungen, zu deren häufigsten die Alzheimer Demenz mit weltweit über 50 Millionen Betroffenen zählt. Auch die hier ausgeschriebene Stelle betrifft diesen wichtigen Forschungsbereich. Bei uns arbeiten Sie in einem dynamischen Team mit internationalen Studierenden und Wissenschaftler:innen. Wir suchen Mitarbeiter:innen, die sich in unserem Team wohlfühlen und unsere Projekte mit uns zusammen vorantreiben möchten.

Dieses Projekt konzentriert sich auf die Hochdurchsatzdatenanalyse von Transkriptomik, Proteomik, Einzelzellsequenzierungsdaten und digitaler Neuropathologie von Gehirnen mit familiärer Alzheimer-Krankheit.

Bei diesem Projekt handelt es sich um ein Drittmittelprojekt, das zunächst auf 2,5 Jahre befristet und mit 75 Prozent der regelmäßigen wöchentlichen Arbeitszeit zu besetzen ist.

What we look forward to

• Einen Doktortitel, einen Master oder einen gleichwertigen Abschluss in Biostatistik / maschinellem Lernen, computergestützter Biologie oder Bioinformatik.
• Vorkenntnisse und Erfahrung mit grundlegender molekularbiologischer Bioinformatik und Datenanalyse, einige Erfahrung mit der Analyse von Einzelzellsequenzierungsdaten und maschinellem Lernen sind für diese Bewerbung erforderlich.
• Nachgewiesene Fähigkeiten und Kenntnisse in Biostatistik und biomedizinischer Datenverarbeitung.
• Erfahrung und Kenntnisse in der Analyse von Multiomics-Daten, mit Schwerpunkt auf Proteomik und Einzelzell-Transkriptomik.
• Kenntnisse in der groß angelegten Bildanalyse.
• Frühere Erfahrungen mit der Verarbeitung großer Datenmengen und Statistik / maschinellem Lernen.
• Programmierkenntnisse in Python, Umgang mit Jupyter Notebook und R-Plattformen, Analyseerfahrung mit Seurat und zugehörigen Paketen.
• Erfahrung mit der Dimensionalitätsreduktion von Daten, Datenpräsentation und Website-Schnittstellen.
• Die Kommunikation mit dem Gruppenleiter und die gemeinsamen Sitzungen finden in englischer Sprache statt; gute Kenntnisse und die Fähigkeit, sich in dieser Sprache auszudrücken, sind erforderlich. Als vollwertiger Partner im Team werden Sie aktiv an vielen Sitzungen teilnehmen.
• Lernbereitschaft, Kommunikationsfähigkeit, Selbstständigkeit.

What we can offer

• Geregelte Bezahlung nach TVöD/VKA; attraktive betriebliche Altersvorsorge und verschiedene Mitarbeitendenrabatte
• 30 Tage Urlaub; Möglichkeit zum Sonderurlaub und Sabbatical
• Zentrale Lage: Unsere Klinik liegt zentral am schönen Eppendorfer Park
• Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum HVV-ProfiTicket und Dr. Bike Fahrradservice; Option zum Dienstrad-Leasing
• Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander und offener Wissensaustausch im Team; strukturierte Einarbeitung
• Möglichkeit, im Rahmen unseres Mitarbeitendenprogramms (UKE INside) aktiv die Arbeitswelt mitzugestalten und weiterzuentwickeln
• Umfangreiche Fortbildungsprogramme (UKE-Akademie)
• Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen
• Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote
• Gesunde und abwechslungsreiche Mittagspause: Zusätzlich zu unserer Kantine gibt es nur wenige Schritte entfernt noch eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten, beispielsweise die „Health Kitchen“ Cafés und Bistros, sowie weitere Imbisse, Bäcker, einen Supermarkt etc.