Arbeiten am Puls der Zeit

Post-doc in biomedical deep learning with genomic data


Work on the pulse of time

Postdoktorat in Biomedical Deep Learning mit Genomik-Daten

Institute of Medical Systems Biology (IMSB), located at the University Medical Care Center Hamburg-Eppendorf (UKE)

We are the University Medical Centre Hamburg-Eppendorf (UKE), a vibrant healthcare community right at the heart of Hamburg. There is a real buzz of energy here, as progress sets the pace and every day offers fresh experiences. Around 11,000 members of staff with a myriad of roles are united in pursuit of a single aim: human well-being. With more than 140 different professions, we are the ideal place for anyone who loves to work in a flexible environment and is ambitious to advance their own personal development and that of healthcare as a whole.

What to expect

The Institute of Medical Systems Biology, located at the University Medical Care Center Hamburg-Eppendorf, focuses on developing and deploying AI solutions for biomedical data. It is a founding member of the bAIome Center for Biomedical AI (www.baiome.org) that aims to bring next-generation software solutions into the clinic.

We currently offer postdoctoral positions in deep learning with genomic data and are looking for highly motivated researchers to complement our lively and enthusiastic team of scientists. Embedded in our genomic AI group, the successful candidate will develop state-of-the art deep learning-based algorithms and apply them to a wide range of problems.

Over the last few years, the group has built a track record in the development of novel deep learning architectures (e.g. GANs, Auto-Encoders) to model, integrate, and simulate unobserved medical processes using genomic biomedical data.

While the candidate will be expected to carry out her/his own research directions, she/he will also assume a leadership position in this group, in continuity with its existing track record

What we look for in a candidate

  • PhD in mathematics, computer science, bioinformatics or related fields.
  • Publications in top-tier journals or conferences in the field of machine and deep learning.
  • Experience in at least one of the following areas: generative modeling, domain adaptation, multi-modal data integration, expression data.
  • Proficiency in Python, ML stack (Tensorflow or Pytorch, docker, git), and Linux environments.
  • Good communication skills, fluency in English, and highly motivated with an interest to work in an interdisciplinary team spanning Machine Learning, Bioinformatics, and Medicine.
  • Experience in writing grant proposals and with agile methodology would be a plus.

What we can offer

  • An innovative, family-friendly working environment right in the middle of Hamburg (day nursery, free child care during the school holidays).
  • Opportunity to participate in a wide range of vocational training, continuing and further education courses at the UKE Academy for Education and Careers, as well as a broad spectrum of introductory events.
  • Use of diverse and multiple award-winning health and illness-prevention offers.

Your UKE

Wir sind das UKE. Die pulsierende Gesundheitsstadt inmitten von Hamburg. Wo so viel Energie in der Luft liegt und der Fortschritt den Takt angibt, ist kein Tag wie der andere. Rund 11.000 Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter mit sehr unterschiedlichen Aufgaben eint hier das gleiche Ziel: das Wohl des Menschen.

Für dieses Ziel arbeiten wir eng zusammen – ganz gleich, ob in Forschung oder Lehre, ob in Klinik oder Verwaltung. Wir sind ein komprimierter Kosmos und für manche Mitarbeiter sogar wie eine große Familie. Sie wollen mit uns die Gesundheitsversorgung voranbringen und dabei auch persönlich wachsen? Von den Besten lernen, Gewohntes in Frage stellen und in ganz neuen Mustern denken?

Willkommen im UKE. Willkommen am Puls der Zeit.

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Möglichkeiten Ihrer Bewerbung auf einen Blick

Bewerben Sie sich, wie Sie sich am wohlsten fühlen.
Sie können uns Ihre Bewerbung schnell und einfach zukommen lassen – online, per E-Mail oder über den Postweg . Alternativ können Sie Ihre Unterlagen auch persönlich bei unserem Recruitment-Team abgeben.
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Wir leben Diversität und schätzen Vielfalt
Wir bieten ein Arbeitsumfeld, das unabhängig von Alter, Geschlecht, sexueller Identität, Behinderung, Herkunft oder Religion gleiche Chancen ermöglicht. Dieses bestätigen wir mit dem Beitritt zur Charta der Vielfalt. Wir streben ausdrücklich eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an, insbesondere beim wissenschaftlichen Personal in Forschung und Lehre. Gleiches gilt im Falle einer Unterrepräsentation eines Geschlechts im ausschreibenden Bereich. Personen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung vorrangig berücksichtigt.
> Hier erfahren Sie mehr zum Thema Diversity im UKE

Your Perspective

Hamburg und sein UKE. Wir sind Teil dieser Stadt und doch eine ganz eigene Welt. Denn bei uns dreht sich alles um eins: Menschen und ihre Gesundheit. Dieses Thema lässt uns nicht los und bringt uns alle zusammen, auch wenn unsere Aufgaben ganz unterschiedlich sind. Wissen, forschen, heilen und noch viel mehr – hier sieht sich jeder als UKE-ler.

Mit über 140 verschiedenen Berufsbildern - in der Pflege und vielen Gesundheitsberufen, als Arzt/Ärztin, im Medizinisch Technischen Dienst oder therapeutischen und pädagogischen Berufen sowie in der Forschung und Lehre bis hin zur Karriere in der Verwaltung oder im Technik- und Servicebereich - sind wir der ideale Ort für alle, die Handlungsspielraum lieben sowie die Dinge und sich selbst voranbringen wollen.

Willkommen in einem komprimierten Kosmos. Willkommen am Puls der Zeit.

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Contact:

Please submit a CV, cover letter, and two references to Prof. Dr. Stefan Bonn, e-mail: sbonn@uke.de

We look forward to receiving your completed application by 23. August 2021 stating reference code 2021-504_eng.

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